脂肪酸甲酯乙氧基化物磺酸盐FMES产品含有大量磷，产品总磷含量高达5500ppm，大量使用导致废水磷含量高于国家规定排放标准。如杭州市环保局制定的《纺织染整工业水污染物排放标准》中，总磷的排放浓度限制为0.5个ppm，FMES的含磷量超出了11000倍。
随着各地对环保要求越来越高，使用FMES不仅会给废水排放带来极大麻烦。另一方面FMES在性价比方面也并不高，FMES一般用做精练剂，但毛效偏低，原料价格贵，性价比较差，做前处理原料会导致成本明显提高。
对FMES的性价比分析：
1.FMES烘干后的固体成分只有65%，FMES折成99%含量价格也高达17元/公斤，阴离子产品能卖到这个价格也属天价了，毕竟AES、十二烷基苯磺酸等只有七八千一吨。
2.FMES耐碱性能没有宣传的那么好，耐碱性能仅为常温的30g/L片碱和100度沸煮条件下约20g/L片碱。
3.FMES的耐硬水能力很差，在硬水条件下净洗性能大幅降低。
4.FMES渗透性能远差于十二烷基苯磺酸钠与仲烷基磺酸钠。
5.FMES泡沫很高，有消泡现象，成分中检测出有机硅消泡剂成分，高温条件下有可能会产生硅斑。
6.FMES含有大量苯环导致废水COD和BOD值很高。
